世界首个枣全基因组测序完成
31.10.2014 12:47
本文来源: 林业厅
科技日报讯 (记者刘廉君)10月29日,国际权威科学杂志《自然通讯》在线发表了以河北农业大学刘孟军教授为第一和通讯作者的枣基因组测序重大研究成果《枣复杂基因组测序及其果树生物学性状解析》。他们在世界上率先完成了枣树的全基因组测序,并使枣树成为世界鼠李科植物和我国干果中第一个完成基因组测序的物种,标志着我国在枣组学研究方面达到国际领先水平。
枣树原产我国,已有7000多年栽培历史,年产量600万吨,占世界99%。2010年,刘孟军带领其枣研究团队,通过与华大基因公司等合作,成功完成了对我国著名枣品种“冬枣”的全基因组从头测序。
该项目组装出总长4.38亿个碱基的高质量基因组序列,达到枣估测基因组大小的98.6%,并且将其中80%的碱基锚定到枣的12条假染色体上;预测出32808个蛋白质编码基因,从中发现了大量的枣特色基因,特别是在第一号染色体上,发现了一段与枣树独特生物学性状密切相关的高度保守区域。
在完成基因组测序组装基础上,对枣树多个优异性状的形成机制进行了深度研究。枣果是世界上已知维生素C(Vc)含量最为丰富的果品之一,高出苹果数十倍,甚至超过有“Vc王”之称的猕猴桃,但枣果为何能够大量积累Vc,一直是个谜。本项目通过比较基因组研究,结合转录组测序和Vc代谢分析,首次发现枣果同时具有柑橘和猕猴桃两种高效积累Vc的分子机制。
该研究对揭开枣树进化和生长发育之谜、加速枣树分子育种必将产生重大而深远的影响,对鼠李科乃至其他果树的分子遗传改良也具有十分重要的理论借鉴和潜在应用价值。
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31.10.2014 12:47